A选项正确：投资估算指标以独立的建设项目、单项工程或单位工程为对象。
B选项错误：投资估算指标往往根据历史的预、决算资料和价格变动等资料编制，但其编制基础仍然离不开预算定额、概算定额。
C选项正确：内容因行业不同而各异，一般可分为建设项目综合指标、单项工程指标和单位工程指标三个层次。
D选项错误：单位工程指标按规定应列入能独立设计、施工的工程项目的费用，即建筑安装工程费用。
E选项错误：建设项目综合指标一般以项目的综合生产能力单位投资表示。