根据《建筑设计防火规范》GB 50016—2014(2018年版)3．4．1注2，两座厂房相邻较高一面外墙为防火墙，或相邻两座高度相同的一、二级耐火等级建筑中相邻任一侧外墙为防火墙且屋顶的耐火极限不低于1．00h时，其防火间距不限，但甲类厂房之间不应小于4m题干中两座甲类厂房的建筑面积均为1000㎡，故耐火等级最低为二级：两座丙、丁、戊类厂房相邻两面外墙均为不燃性墙体，当无外露的可燃性屋檐，每面外墙上的门、窗、洞口面积之和各不大于外墙面积的5％，且门、窗、洞口不正对开设时，其防火间距可按本表的规定减少25％，A选项正确；E选项错误。
3.4.5 丙、丁、戊类厂房与民用建筑的耐火等级均为一、二级时，丙、丁、戊类厂房与民用建筑的防火间距可适当减小，但应符合下列规定： 当较高一面外墙为无门、窗、洞口的防火墙，或比相邻较低一座建筑屋面高15m及以下范围内的外墙为无门、窗、洞口的防火墙时，其防火间距不限。B选项错误；
根据3．4．1注3，两座一、二级耐火等级的厂房，当相邻较低一面外墙为防火墙且较低一座厂房的屋顶无天窗，屋顶的耐火极限不低于1．00h，或相邻较高一面外墙的门、窗等开口部位设置甲级防火门、窗或防火分隔水幕或按本规范第6．5．3条的规定设置防火卷帘时，甲、乙类厂房之间的防火间距不应小于6m；丙、丁、戊类厂房之间的防火间距不应小于4m。选项中未说明较低厂房无天窗，C选项错误；
根据3．4．1注6，两座一、二级耐火等级的丙、丁、戊类厂房与丙、丁、戊类仓库相邻时，应满足本表注2、3的规定，选项中有乙类仓库，不符合防火间距减免条件，D选项错误。本题答案为BCDE。