商品投资基金与对冲基金比较类似，但也存在明显区别，主要体现在：第一，商品投资基金的投资领域比对冲基金小得多，它的投资对象主要是在交易所交易的期货和期权，因而其业绩表现与股票和债券市场的相关度更低；第二，在组织形式上，商品投资基金运作比对冲基金规范，透明度更高，风险相对较小。正是由于商品投资基金给投资者提供了一种投资传统的股票和债券所不具有的特殊的获利方式，并且其投资资产同传统资产相关度很低，因此，商品投资基金和对冲基金通常被称为另类投资工具或其他投资工具。