《关于进一步加强水生生物资源保护严格环境影响评价管理的通知》（环发[2013]86号）规定，水产种质资源保护区影响专题论证的重点是种质资源保护区主要物种资源和功能分区等情况，建设项目对保护区功能影响及建设项目优化布局方案，拟采取的避让、减缓、补救和生态补偿措施等。