银行业金融机构在全面风险管理中应当遵循的基本原则包括：匹配性原则、全覆盖原则、独立性原则和有效性原则。其中，独立性原则是指银行业金融机构应当建立相对独立的全面风险管理组织架构，赋予风险管理条线足够的授权、人力资源及其他资源配置，建立科学合理的报告渠道，与业务条线之间形成相互制衡的运行机制。