地方性法规与部门规章之间对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用时，由国务院提出意见（而非全国人大常委会，选项 CD 错误），国务院认为应当适用地方性法规的，应当决定在该地方适用地方性法规的规定（选项 A 正确），认为应当适用部门规章的，应当提请全国人民代表大会常务委员会裁决（而非全国人大，选项 B 错误）。