单纯的年度预算平衡存在一些缺陷：①容易忽略潜在的财政风险。一些预算决策在年度间的实施不易做到瞻前顾后，容易在决策的合理性和资金保证上出现偏差。②在年度预算中，各项收支已由预算确定好了，具有法律性，这样，在一个预算年度内进行收支结构的调整就受到了限制，与年度内的不确定因素产生矛盾。③年度预算平衡限制了政府对未来的更长远的考虑。而跨年度预算平衡突出的优点就是有利于政策的长期可持续性，使决策者能够尽早发现问题，鉴别风险，采取措施，防患于未然。