本题考查的知识点为质量责任的损失赔偿
A正确，缺陷责任期满后，应当返还质量保证金。
B错误，建设工程的保修期，自竣工验收合格之日起计算。缺陷责任期从工程通过竣工验收之日起计；由于承包人原因导致工程无法按规定期限进行竣工验收的，缺陷责任期从实际通过竣工验收之日起计；由于发包人原因导致工程无法按规定期限进行竣工验收的，在承包人提交竣工验收报告90天后，工程自动进入缺陷责任期。起始日不一定一致。
C正确，发承包双方约定的保修期限不得低于条例规定的期限，但可以延长。缺陷责任期一般为1年，最长不超过2年，具体可由发、承包双方在合同中约定。
D错误，缺陷责任期内，由他人原因造成的缺陷，发包人负责组织维修，承包人不承担费用，且发包人不得从保证金中扣除费用。
E错误，采用工程质量保证担保、工程质量保险等其他保证方式的，发包人不得再预留保证金。