根据《建筑设计防火规范》知：
3.1.1生产的火灾危险性应根据生产中使用或产生的物质性质及其数量等因素划分，可分为甲、乙、丙、丁、戊类，并应符合表3.1.1的规定。查条文说明可知，棉花仓库的火灾危险性为丙类。
3.3.2除本规范另有规定外，仓库的层数和面积应符合表3.3.2的规定。查表3.3.2可知，二级耐火等级的单层丙类2项仓库每个防火分区的最大允许建筑面积不应大于1500m²，故选项A正确。
本题分析:一、二级耐火等级且占地面积不大于2000m²的单层棉花库房,其防火分区的最大允许建筑面积不应大于2000m²。本题并未交代仓库的占地面积不大于2000m²，故还是按规范一般情况执行，选择1500m²。