住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期。A选项正确。
建设用地使用权包括地上和地下，可采取出让方式也可采取划拨方式，B选项错。
建设用地使用权自登记时设立。C选项错。
建设用地使用权只能存在于国家所有的土地上，不包括集体所有的农村土地。D选项正确。
设立建设用地使用权，可以采取出让或者划拨等方式。 E选项正确。
因此本题正确选项为A、D、E。