盾构法施工也存在以下一些问题：
(1)当隧道曲线半径过小时，施工较为困难。
(2)在陆地建造隧道时，如覆土太浅，则盾构法施工困难很大，而在水下时，如覆土太浅则盾构法施工不够安全。
(3)盾构施工中采用全气压方法以疏干和稳定地层时，对劳动保护要求较高，施工条件差。
(4)盾构法隧道上方一定范围内的地表沉降尚难完全防止，特别在饱和含水松软的土层中，要采取严密的技术措施才能把沉降控制在很小的限度内。
(5)在饱和含水地层中，盾构法施工所用的拼装衬砌，对达到整体结构防水的技术要求较高。
(6)对于结构断面尺寸多变的区段适应能力较差。