选项A错误，工程继续施工将会对第三者或社会公共利益造成损害；选项C错误，承包人发生合同约定的违约行为，且在合同约定时间内未按监理机构指示纠正其违约行为，或拒不执行监理机构的指示，从而将对工程质量．安全．进度和资金控制产生严重影响，需要停工整改；选项D错误，属于监理机构“可”签发暂停施工指示的情形，本题问的是“应”签发暂停施工指示的情形。