《水利工程建设项目管理规定(试行)》(2016年修订) (水建[1995]128号)明确，水利工程项目建设实行项目法人责任制、招标投标制和建设监理制，简称"三项"制度 。 A选项正确。
水利工程建设监理是指具有相应资质的水利工程建设监理单位，受项目法人(或建设单位)委托，按照监理合同对水利工程建设项目实施中的质量、进度、资金、安全生产、环境保护等进行的管理活动。B选项错。
水利工程建设监理实行总监理工程师负责制。 C选项正确。
水利工程建设项目代建制为建设实施代建，代建单位对水利工程建设项目施工准备至竣工验收的建设实施过程进行管理。 D选项正确。
依据财政部《基本建设项目建设成本管理规定》，同时满足按时完成代建任务、工程质量优良、项目投资控制在批准概算总投资范围内3个条件的，可以支付代建单位利润或奖励资金，一般不超过代建管理费的10%。E选项正确。