水利PPP项目由项目所在地县级以上人民政府授权的部门或单位作为实施机构。A选项错。

对新建项目，其中经济效益较好，能够通过使用者付费方式平衡建设经营成本并获取合理收益的经营性水利工程，一般采用特许经营合作方式 。 B选项正确。

水利PPP项目实施机构依据经批准的实施方案，组织起草PPP项目合同草案。 C选项正确。

项目实施机构可依法采用公开招标、邀请招标、竞争性谈判等方式，综合考虑投资能力、管理经验、专业水平、融资实力以及信用状况等因素，公开公平公正择优选择社会资本方作为水利PPP项目合作伙伴。 D选项正确。