导致区域经济发展不平衡的主要因素有：(1)区域自然条件的差异。自然条件是经济社会发展的重要因素，它会在总体上对不同区域的经济发展造成直接影响，通常来说，自然条件差的区域，经济发展水平也比较低。 (2) 资源禀赋的差异。资源禀赋指的是区域拥有的生产要素数量和质量，包括自然资源、劳动力、资本、技术等。资源禀赋的差异会导致生产成本和生产效率的不同，从而造成区域之间经济发展水平的不平衡。 (3) 分工水平的差异。区域分工的差异以资源禀赋不同为基础，不同的资源禀赋条件会有不同的分工差异，拥有科学技术优势的区域在分工中占有更多的优势，这也会造成不同区域之间发展水平的不同。 (4) 区域经济结构差异。经济结构差异是造成区域发展差异的重要原因，二者存在着一种互为因果的关系，经济结构水平低，其经济发展水平就难以提高，而经济发展水平低，其经济结构优化和升级也难以实现。(5) 社会历史的差异。一个区域在经济发展过程中，历史形成的文化传统、区域习惯、体制机制特征，都会直接影响经济社会发展，从而成为区域经济发展不平衡的重要因素之一。