在工程项目开工前，监督机构接受建设单位有关建设工程质量监督的申报手续，并对建设单位提供的有关文件进行审查，审查合格签发有关质量监督文件。工程质量监督手续可以与施工许可证或者开工报告合并办理。A错误；
监督机构对工程实体质量监督抽样检测的重点是涉及结构安全和重要使用功能的项目，B正确；
项目工程质量监督档案按单位工程建立。C错误；
监督工程竣工验收重点对竣工验收的组织形式、程序等是否符合有关规定进行监督;同时对质量监督检查中提出质量问题的整改情况进行复查，检查其整改情况。D错误。