合同实施偏差处理的组织措施包括增加人员投入、调整人员安排、调整工作流程和工作计划等，故A项错误。合同实施偏差分析的内容包括：①产生偏差的原因分析；②合同实施偏差的责任分析；③合同实施趋势分析，故B项错误。工程变更的范围包括取消合同中任何工作，但转由他人实施的工作除外，故C项错误。根据工程实施的实际情况，以下单位都可以根据需要提出工程变更：①承包商；②业主方；③设计方，故D项正确。故本题选D。