施工企业与本企业项目经理签订内部承包合同，是施工企业内部调动员工积极性，提高管理水平的一种合法方式。总包人、分包人均可将全部工程的劳务作业分包给具有相应劳务分包资质的施工企业。将工程主体交由他人完成，属于违法分包情形。故A、B、C选项均非正确选项。
《房屋建筑和市政基础设施工程施工分包管理办法》规定，分包工程发包人没有将其承包的工程进行分包，在施工现场所设项目管理机构的项目负责人、技术负责人、项目核算负责人、质量管理人员、安全管理人员不是工程承包人本单位人员的，视同允许他人以本企业名义承揽工程。
故D选项为正确选项。