本题考查斗谱编排基本原则。
A选项，当归与独活属于外观性状相似但功效不同的饮片，不宜排列在一起。
B选项和D选项，天葵子与冬葵子、藜芦与漏芦均属于药名相近，但性味功效不同的饮片，不应排列在一起。
C选项，巴豆与牵牛子属于“十九畏”配伍禁忌，斗谱排列时不能装于一斗及上下斗。
E选项，法半夏与川贝母可排列在一起。
故正确答案是E。