上海黄金交易所按照“集中、净额、分级”的原则进行清算。其中：“集中”是指上海黄金交易所为会员提供集中清算，由上海黄金交易所继承交易双方的权利及义务；“净额”是指上海黄金交易所对会员在交易所的成交额进行轧差处理；“分级”是指上海黄金交易所负责对会员实行清算，会员负责对其代理客户实行清算。