建设工程档案的验收应纳入建设工程竣工联合验收环节 。A选项正确。
勘察、设计、施工、监理等单位应将本单位形成的工程文件立卷后向建设单位移交 。B选项正确。
每项建设工程应编制一套电子档案，随纸质档案一并移交城建档案管理机构。C选项正确。
电子档案签署了具有法律效力的电子印章或电子签名的，可不移交相应纸质档案。D选项正确。
建设工程项目实行总承包管理的，总包单位应负责收集、汇总各分包单位形成的工程档案，并应及时向建设单位移交；各分包单位应将本单位形成的工程文件整理、 立卷后及时移交总包单位 。E选项错。