问题1：
招标文件的内容不正确。作为公开招标项目不应该有投标邀请书，应该为招标公告；同时还遗漏了合同主要条款、投标文件格式等内容。
根据招标投标的相关规定，该施工招标项目的招标文件包括下列内容：
（1）招标公告。
（2）投标人须知。
（3）合同主要条款。
（4）投标文件格式。
（5）工程量清单。
（6）技术条款。
（7）设计图纸。
（8）评标标准和方法。
（9）投标辅助材料。
问题2：
招标文件设置的投标人资格条件中，有以下条件不妥：
（1）“需具备水利水电工程施工总承包一级以上资质”的条件不妥。
理由：该案例为小（1）型水利水电工程，按相关规定，水利水电工程施工总承包三级资质即可承揽。设置该条件，属于《招标投标法实施条例》明确的，设定了资格与招标项目的实际需要不相适应的条件的行为。
（2）“获得过本省施工质量优秀奖项”的条件不妥。
理由：作为依法必须招标项目，设置该条件，违反了《招标投标法实施条例》明确的，招标人不得以不合理的条件限制、排斥潜在的投标人，不得对潜在投标人实施歧视待遇的规定。
（3）“变电所二次设备继电保护装置，要采用××企业生产的继电保护设备”的条件不妥。
理由：设置该条件，属于《招标投标法实施条例》明确的，指定了特定的品牌或者供应商的行为。
（4）“本地企业注册资金不低于1000万元，外地企业注册资金不低于3000万元”的条件不妥。
理由：设置该条件，属于《招标投标法实施条例》明确的，对潜在投标人或者投标人采取不同的资格审查标准的行为。
问题3：
规定（1）不正确。理由：根据招标投标的相关规定，招标人对已发出的招标文件进行必要的澄清或者修改的，应当在招标文件要求提交投标文件截止时间至少十五日前。
规定（2）不正确。理由：根据招标投标的相关规定，自招标文件开始发出之日起至投标人提交投标文件截止之日止，最短不得少于二十日。
规定（3）不正确。理由：根据招标投标的相关规定，投标人撤回已提交的投标文件，只要在投标截止时间前书面通知招标人就可以。
规定（4）不正确。理由：根据招标投标的相关规定，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。